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目的:如何分析在阿尔茨海默氏病(AD)模型小鼠的前额叶皮层中差异表达的基因,以确定转录组水平上AD的病因?
方法:在这项研究中,是否提取了5只9个月大的雌性APPswe /PS1ΔE9(PAP)模型小鼠和野生型C57BL/6J小鼠,提取了前额叶RNA,并用Illumina HiSeq3000进行了测序?您是否使用EdgeR软件分析表达差异的重要性? AD和对照组分析基因表达的变化并使用qRT。 PCR验证六个主要差异表达基因?接下来,对差异表达基因进行聚类分析?
结果:AD组和对照组的差异表达基因(P1.0)为224、其中205个上调而19个下调? 6个主要基因qRT? PCR验证结果是否与RNA匹配?趋势? GO功能富集分析的结果是这些差异表达的基因是免疫反应吗?炎?已经表明它与趋化因子活性和IgG结合有关; KEGG途径富集分析的结果表明,这些基因与吞噬作用,溶酶体,Toll样受体信号传导途径和细胞因子受体相互作用有关。 κB信号传导。途径和其他重要的生物学途径?
结论:获得与AD相关的差异表达基因,并为在AD相关机制和治疗研究中使用模型小鼠提供实验证据?
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