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目的:研究野生实验室饲养和生活条件下东方田鼠肠道菌群的分布和差异?
方法:肠道菌群16SDNA采用高通量测序技术? V4?确定 V5、分析东方田鼠、统计操作分类单位 (OTU) 和在实验室和野外序列中捕获的细菌物种丰度?它与分布不同吗?
结果:对于稀疏曲线,样本数量是否合理,排序是否足够?在门级,实验室培养和野外生存的肠道菌群的分布和比例基本相同。实验组有1个地方性真菌Lentisphaerae,野生组有3个独特的门,梭杆菌?对于未归类为 Taumarkeotaphyllum 的 Philum,Tenericute Philum 的丰度差异最大吗?在属水平上,田鼠肠道细菌比实验室培养的细菌更丰富。最大的差异是管腔瘤胃球菌的丰度?
结论:获得了实验室饲养和野生条件下东方田鼠肠道菌群结构的差异,进一步丰富了东方田鼠的基础生物学数据。
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