目的： 研究不同pH饮用水对SPF小鼠肠道微生物多样性的影响。

方法： 21日龄SPF小鼠90只随机分成3组，每组30只，分别给予三类水，即酸化水（pH 3.0），中性水（pH 7.0）和碱性水（pH 9.0），并进行为期三个月的饲养。每组分别在饲养4周、8周、12周末各处死10只动物，取血清按SPF国标项目检测了细菌、病毒、寄生虫，取回盲部内容物，根据细菌16S rRNA的保守性设计引物，构建文库，进行高通量（Illumina）测序，获得10 G的数据，并对数据进行统计，聚类分析。

结果： 以pH 3.0处理的小鼠肠道微生物丰富度适中，稳定性高。

结论： 在规模化饲养条件下，选取pH 3.0饮用水小鼠能较长时间维持肠道微生物多样性，稳定性达到一个平台。本研究为长期稳定维持动物质量的生产实践提供了理论与技术支持，也是胃肠道宏基因组学技术在动物质量控制领域的一个具体应用。