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分子生物学技术miRNA

FISH和PRINS技术

一、荧光原位杂交(FISH)


       是一种简单、敏感、而容易操作的方法,结果迅速,并能在同一标本上检测多个不同的基因,可应用于细胞培养、染色体分裂像、冰冻切片和石蜡切片。


       FISH技术是利用特异的DNA探针,标记了生物素,地高辛、或荧光素,对检测细胞进行DNA-DNA原位杂交,并用荧光法显示。


FISH实验步骤


试剂配制:


       (1)变性液(70%甲酰胺 + 2×SSC,pH7.0):4 ml 20×SSC;8 ml 蒸馏水;28 ml 甲酰胺。每次新鲜配制。


       (2)杂交后洗涤液: 20×SSC 4 ml;蒸馏水16 ml;甲酰胺20 ml。每次新鲜配制。调节pH前升至室温。
 
       1.  用硅化玻片,石蜡切片,60℃烤片过夜。二甲苯脱蜡至酒精,斜置切片,空气中干燥。


       2.  蛋白酶处理:


       (1)每个染色缸40 ml 蛋白酶K消化溶液,配制方法如下:2×SSC 40 ml 倒入Facal管,在水浴槽中预热。将消化酶液加入管内,摇动直到酶溶解。


       (2) 37℃水浴槽中预热染色缸和蛋白酶K溶液。37℃孵育20 min。


       (3) 2×SSC在室温下漂洗切片3次,每次1 min。


       (4)梯度酒精脱水(-20℃预冷),空气中干燥。


       3.  变性:


       (1)每一个立式染色缸配制40 ml 变性溶液;


       (2)78℃水浴槽中平衡预热混合液染色缸;


       (3)78℃孵育8 min;


       (4) 即移入-20℃预冷70%酒精的染色缸内2 min,再依次移入80%、90%和100%的-20℃预冷酒精内,每缸2 min;


       (5)空气干燥。


       4.  杂交:


       (1)准备探针;


       (2)取一个较大的湿盒,交叉放置切片;


       (3)滴10 μl 探针在切片的组织上,加盖玻片;


       (4)盖上湿盒盖,37℃孵育12~16 h。


杂交后水洗:


       (5)镊子小心去除盖玻片;


       (6)43℃预热杂交后水洗溶液40 ml 水洗切片15 min;


       (7)2×SSC(37℃)洗两次,每次10 min;


       (8)切片放人染色缸的1×PBS内待检测,勿使切片干燥。


检测:


       (9)从1×PBS中取出切片,除去过多的水分,避免标本干燥。把切片放入湿盒内,同时处理4张切片。


       (10)每张切片使用30~60 μl 罗丹明抗-地高辛抗体或FITC卵白素,室温下孵育20 min;


       (11)去掉塑料盖膜,把切片放入含1×PBS的染色缸。1×PBS室温下洗3次,每次2 min。


扩增:


       (12)从1×PBS中取出切片,斜置切片使液体排出;


       (13)每张切片滴30~60 μl 抗-卵白素抗体,加塑料盖膜,室温孵育20 min;


       (14)去掉塑料盖膜,把切片放入含1×PBS的染色缸。1×PBS室温下洗3次,每次2 min;


       (15)从1×PBS中取出切片,斜置切片使液体排出;


       (16)每张切片滴30~60 μl 抗-卵白素抗体,加塑料盖膜,室温孵育20 min;


       (17)1×PBS室温下洗3次,每次2 min。


       5.  细胞核染色:


       (1)张切片加10~20 μl DAPI,覆盖盖玻片并在室温下孵育2~5 ml;


       (2)尽可能快的在荧光显微镜下观察或封闭盒内保存在-20℃冰箱。切片在染色之后1h内可以在显微镜下观察。
 

二、用引物介导的原位标记(PRINS)


       是PCR和荧光原位杂交(FISH)的结合, PRINS是由未标记的序列特异性寡核苷酸探针与固定在细胞内的靶DNA互补序列,在聚合酶的驱动下,带有标记的脱氧核苷酸(FITC-dUTP或半抗原-dUTP)和dATP、dCTP、dGTP的延伸,依赖标记,新合成的DNA就能直接的或间接的带有FITC,用荧光显微镜观察。


PRINS实验步骤


       1.  常规脱蜡浸入0.01 mol/L PBS;


       2.  用0.2 mol/L 盐酸处理5min;


       3.  蛋白酶K(25 μg/ml)消化37℃ 15 min;


       4.  分别用80%,95%和100%酒精脱水,室温干片;


       5.  加PCR混合液25 μL(10 mmol/L Tris-HCl,50 mmol/L KCl,1.5 mmol/L MgCl2,各加200 μmol/L dATP,dCTP,dGTP,1.5 mmol/L dig-11-dUTP 1.5 μl,引物250 ng,Taq DNA聚合酶2 U),加盖片;


       6.  94℃变性5 min后置入65℃湿盒中5 min;


       7.  用0.1×SSC液,65℃洗5 min;


       8.  片于65℃ 10~20 s;用4×SSC-0.1%吐温20液42℃洗5 min,2次;


       9.  经Buffer 1液洗后滴加20%羊血清封闭30 min;


       10.  加地高辛抗体复合物(1:500)室温下2 h;


       11.  BufferⅢ液洗5 min;


       12.  用BCIP-NBT显色1~2 h,在镜下控制,终止显色;


       13.  用中性红或核固红衬染,酒精脱水,二甲苯透明,树脂封片。

FISH

      (本文转载丁香通)

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