分子生物学技术miRNA
1. MSP原理:MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,然后用3对特异性的引物对所测基因的同一核苷酸序列进行扩增。扩增产物用DNA琼脂糖凝胶电泳,凝胶扫描观察分析结果。
(1)在50ul体系中,DNA(2~5 μg)经NaOH(终浓度值0.2 mol/L)在37℃变性10 Min。对于ng级别的人基因组DNA,在进行修饰前加入2μg蛙鱼精DNA为载体。
(2)加入30 μl刚配制好的10 mmo/L 氢醌与520/1的40.5%亚硫酸氢钠混匀,之后石蜡油隔绝空气的条件下,避光在50%温育16 h。
(3)修饰后的DNA过WizerdDNA纯化柱,用50/1 L 水洗脱。室温下用NaOH(终浓度为0.3 mol/L)修饰5 min,之后用乙醇沉淀。
(4)DNA溶于20 μl 水中,立即使用或在-20℃保存。
3. MSP优点与缺点:与其他方法相比,MSP从非甲基化模板背景中检测甲基化模板的敏感性大大提高,是最敏感的甲基化测定方法。其缺点是需要两组已知的关键性CpG位点设计上下游引物,并且这些位点必须完全甲基化或完全不甲基化。
事实上,能够完全满足这些条件的基因数目不多,该方法具有明显的基因“选择性”。在很多情况下,为了扩增PCR产物,不得不降低退火温度,其后果是形成许多非特异性产物。随着退火温度的降低,该方法可靠性也随之下降。
(本文转载丁香通)
上一篇:PCR-SSCP原理和操作步骤
下一篇:基因克隆技术
上海展辉生物技术有限公司
地址:上海市浦东新区东方路
联系电话:400-689-6719
联系邮箱:3369352092@qq.com
联系我们:
4006896719
扫一扫
关注东洪博元更多动态